Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha6Q62413 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms