Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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AtmQ62388 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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AtmQ62388 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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AtmQ62388 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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AtmQ62388 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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AtmQ62388 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtmQ62388 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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AtmQ62388 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms