Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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