Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ssr4Q62186 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ssr4Q62186 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssr4Q62186 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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