Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms