Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbm38Q62176 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbm38Q62176 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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