Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh1a2Q62148 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh1a2Q62148 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms