Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Prkd1Q62101 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd1Q62101 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms