Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phox2aQ62066 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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