Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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