Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smarcd1Q61466 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smarcd1Q61466 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms