Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccna1Q61456 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms