Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms