Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift20Q61025 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms