Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp7Q60973 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp7Q60973 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.4 ms