Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn2cQ60772 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms