Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mkrn3Q60764 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mkrn3Q60764 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms