Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha1Q60750 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha1Q60750 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms