Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prdm1Q60636 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms