Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CttnQ60598 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms