Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms