Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG73

Acbd5, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd5Q5XG73 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd5Q5XG73 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd5Q5XG73 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms