Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms