Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf1Q5U4C3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms