Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajc11Q5U458 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc11Q5U458 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms