Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myh1Q5SX40 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms