Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms