Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psme4Q5SSW2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psme4Q5SSW2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms