Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TefmQ5SSK3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TefmQ5SSK3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms