Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
5730522E02RikQ5SP45 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
5730522E02RikQ5SP45 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
5730522E02RikQ5SP45 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
5730522E02RikQ5SP45 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
5730522E02RikQ5SP45 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
5730522E02RikQ5SP45 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms