Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttf2Q5NC05 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms