Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf3Q5HZG4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf3Q5HZG4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms