Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SynaQ5G5D5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms