Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ecm2Q5FW85 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ecm2Q5FW85 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms