Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms