Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc8bQ5DU41 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms