Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Rtl5Q5DTT4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Rtl5Q5DTT4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Rtl5Q5DTT4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Rtl5Q5DTT4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Rtl5Q5DTT4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl5Q5DTT4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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