Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ndufaf2Q59J78 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms