Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpjQ569L8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpjQ569L8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms