Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrig2Q52KR2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrig2Q52KR2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms