Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc3lQ4KL14 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms