Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc110Q3V125 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms