Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ccdc185Q3V118 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc185Q3V118 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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