Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cldn34b4Q3V0X2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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