Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp48Q3V0C5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Usp48Q3V0C5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp48Q3V0C5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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