Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5aQ3UXZ9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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