Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms