Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn13Q3UW68 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms