Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Skap1Q3UUV5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms