Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm10Q3UTQ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms